Anti-CRISPR
Anti-CRISPR-proteiinikompleksit (engl. Anti-Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats or Acr) ovat viruksien ja muiden liikkuvien geneettisten elementtien puolustusmekanismeja bakteerien ja arkeonien CRISPR-Cas-komplekseja vastaan.[1] Eri anti-CRISPR:it ovat erikoistuneet torjumaan eri tyyppisiä CRISPR-Cas-järjestelmiä ja hyödyntävät näin ollen erilaisia mekanismeja suojatakseen virusta. Yhteensä yli 90 erilaista anti-CRISPR:iä on tunnistettu, ja nämä ovat kykeneväisiä inhiboimaan 11 erilaisen CRISPR-Cas-järjestelmän toimintaa.Esimerkiksi Csy-kompleksin toimintaan perustuvat I-F tyypin CRISPR-Cas-järjestelmiä vastaan toimivat anti-CRISPR:it voivat estävää bakteeria tai arkeonia puolustautumista kahdella tapaa: joko I-F-tyypin anti-CRISPR:it estävät isäntää aktivoimasta geneettistä materiaalia hajottavien entsyymien, eli nukleaasien, toimintaa tai estävät Csy-kompleksin sitoutumista viruksen geneettiseen materiaaliin.[2]
Anti-CRISPR:it ovat osoittautuneet hyödyllisiksi työkaluiksi biotekniikassa ja näitä käytetään esimerkiksi genomimuokkauksien säätelyssä.[2]
Lähteet
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]- ↑ Carolyn Kraus, Erik J. Sontheimer: Applications of Anti-CRISPR Proteins in Genome Editing and Biotechnology. Journal of Molecular Biology, 1.7.2023, 435. vsk, nro 13, s. 168120. doi:10.1016/j.jmb.2023.168120 ISSN 0022-2836 Artikkelin verkkoversio.
- ↑ a b Chantel N. Trost, Jing Yang, Bianca Garcia, Yurima Hidalgo-Reyes, Beatrice C. M. Fung, Jiuyu Wang, Wang-Ting Lu, Karen L. Maxwell, Yanli Wang, Alan R. Davidson: An anti-CRISPR that pulls apart a CRISPR–Cas complex. Nature, 2024-08, 632. vsk, nro 8024, s. 375–382. doi:10.1038/s41586-024-07642-3 ISSN 1476-4687 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)